Space Gun er et actionfyldt rail shooter-spil, hvor spilleren oplever handlingen fra et førstepersonsperspektiv. Du skal bekæmpe fjendtlige rumvæsener, der har invaderet et forskningsskib og taget besætningen som gidsler. Nogle monstre kan kun besejres ved først at skyde deres lemmer af, mens andre angriber fra luften via mekaniske kanoner. Spilleren skal samtidig redde uskyldige gidsler – men pas på, for enkelte kan pludselig mutere til farlige væsner.

Udover det hurtige standardvåben findes fire alternative våben: flammekaster, granatkaster, frostbombe og kasteblad-bombe, som kræver opsamlet ammunition. Spillet byder på seks til syv baner med flere sektioner, hver afsluttet af en bosskamp. Undervejs kan spilleren vælge forskellige ruter gennem skibet, og korte cutscenes driver historien frem. Strategi er vigtig, da brugen af pedalernes baglæns-bevægelse giver mere tid, men risikerer at koste værdifuld tid på niveauet.